En el gobierno del C.P Antonio Echevarría Domínguez 1999-2005 se aprobó la construcción del Centro Estatal de Cancerología debido al alto índice de población afectada con patologías  Oncológicas en el estado de Nayarit. 

El 16 de enero del 2006 se inician las labores operativas del Centro Estatal de Cancerología de Nayarit, iniciando la atención a pacientes en el área de consulta externa con los servicios de Oncología Médica, Oncología Quirúrgica, Oncología Hematoncológica y Quimioterapia Ambulatoria.

Posteriormente, el 5 de Noviembre del 2007, previo a la inauguración del área de Radioterapia, se otorga el primer tratamiento de Teleterapia con Acelerador Lineal y un Sistema de Planeación Tridimensional, contando con instalaciones normadas por la “Comisión Nacional de Seguridad Nuclear y Salvaguardas” y personal calificado para tal efecto, dando además la atención en esta área del servicio de Braquiterapia de “Baja Tasa de Dosis”.

En el año 2007 el Centro Estatal de Cancerología, logra las primeras  Constancias de Acreditación para otorgar Servicios de Alta Especialidad a través del  Fondo de Protección Contra Gastos Catastróficos, por cumplir como establecimiento público, afiliado al Sistema de Protección Social en Salud (SPSS) .

día 17 de Octubre del 2014 se da el banderazo oficial para el inicio de la obra de ampliación destinada a la atención exclusiva de cáncer infantil, la cual actualmente se encuentra concluida la obra, lo que dio oportunidad de contar con dos consultorios destinados a cáncer infantil, una ludoteca y un área de quimioterapia ambulatoria, lo que sin duda mejorará la calidad de atención de estos pacientes.